Runö S:ta Magdalena kyrka är en träkyrka från 1644 på Runö i Estland. Runö har en lång historia av svenskbygd och här finns många estlandssvenskar. Efter Sovjetunionens fall har en del människor vars föräldrar är härifrån återvänt till bland annat Runö. Detta både som fast boende och som sommarboende.
Kyrkan är Estlands äldsta bevarade träbyggnad. Den började byggas den 22 november 1643 och började användas året därpå. Den fungerade som ersättning för ett ännu äldre kapell som stått i området. Byggnation genomfördes på uppdrag av riksamiral Carl Carlsson Gyllenhielm. Kyrkan används av en evangelisk-luthersk församling på Runö som heter Sankta Magdalena församling.
Området som bland estlandssvenskarna kallas Aiboland, har bebotts av estlandssvenskar sedan 1200- och 1300-talen då deras förfäder anlände från nuvarande Sverige och Finland.
Nästan alla estlandssvenskar flydde till Sverige under andra världskriget och endast ett fåtal bor numera permanent i Estland. Många svenskar deporterades också av ryssar till Gammelsvenskby i Ukraina under 1700-talet så hade svenskarna varit araber hade vi krigat om öarna och Baltikum ännu…
